LEREG

SOBRE O LABORATÓRIO

O LEREG foi criado nos anos 1990 pelo Prof. Paulo Arruda (Instituto de Biologia/Unicamp) no mesmo ano em que foi fundado o CBMEG. O foco das pesquisas do LEREG é a regulação da expressão gênica. Desde a sua criação o LEREG esteve envolvido em grandes projetos colaborativos com instituições nacionais e internacionais o que levou a coordenação de importantes projetos de projeção internacional como o sequenciamento da Xyllela fastidiosa (1997) e da cana-de- açúcar (2002), que representaram marcos na ciência brasileira.

Em 2015, o LEREG trouxe para o CBMEG o acordo com o consórcio internacional de genômica estrutural (SGC – Structural Genomics Consorcium) que resultou na criação do CQMED  (Centro de Química Medicinal). Em 2018, o LEREG passou a sediar o GCCRC (Centro de Genômica Aplicada às Mudanças Climáticas), um Centro de Pesquisa em Engenharia da Fapesp, resultado da parceria Embrapa e Unicamp. Sua missão é a criação de ativos biotecnológicos por meio da genômica aplicada à adaptação de cultivos aos estresses associados às mudanças climáticas.

PESQUISADORES RESPONSÁVEIS

Prof. Dr. Paulo Arruda

Pesquisador e Coordenador

Formado em Biologia pela Universidade Católica de Campinas, ingressou como professor na Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) em 1976, no Departamento de Genética e Evolução, Instituto de Biologia. Na UNICAMP, iniciou trabalhos de pesquisa em genética fisiológica de plantas e fez mestrado e doutorado em genética. Entre 1982e 1983, realizou pós-doutorado no Biochemistry Department, Rothamsted Experimental Station, Inglaterra. De volta ao Brasil em março de 1983, iniciou um grupo de pesquisa em biologia molecular de plantas, área até então incipiente no Brasil. A partir de 1987, coordenou a implantação do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG) da UNICAMP para o desenvolvimento de grupos de pesquisa em biologia molecular principalmente na área vegetal. A partir de então realizou uma série de projetos em colaboração com universidades e instituições de pesquisa, envolvendo vários países da América Latina e da Europa. O seu principal tema de pesquisa é a regulação da expressão gênica. Possui 99 trabalhos em revistas científicas internacionais de alto impacto. Colaborou na organização do Programa Genoma FAPESP, estruturando o projeto de seqüenciamento do genoma da bactéria Xyllela fastidiosa. Nesse projeto coordenou um dos laboratórios centrais responsáveis pelo treinamento dos grupos da rede ONSA. Posteriormente, coordenou o Projeto Genoma da Cana de Açúcar (SUCEST), formado por uma rede de 60 grupos de pesquisa de diversas Universidades e Institutos de Pesquisa brasileiros. O laboratório de biologia molecular de plantas do CBMEG, sob sua liderança, já treinou mais de uma centena de estudantes de iniciação científica, mestres, doutores e pós-doutores, muitos dos quais ocupam posições de destaque em instituições de ensino e pesquisa nacionais e internacionais. Alem das atividades de pesquisa e ensino em nível de graduação e pós-graduação, coordena também um grupo de Educação em Ciências com apoio da Fundação VITAE, FAPESP, CAPES e FINEP. Esse trabalho já treinou centenas de estudantes e professores do ensino médio. Por suas atividades acadêmicas foi agraciado com diversos prêmios e honrarias dentre as quais se destacam: Prêmio Mérito Científico e Tecnológico outorgado pelo Governo do Estado de São Paulo, Prêmio ?Zeferino Vaz? de Reconhecimento Acadêmico concedido pela Universidade Estadual de Campinas, Prêmio Medalha REDBIO 2001 concedido pela Rede Latino-Americana de Biotecnologia/FAO. É membro titular da Academia Brasileira de Ciências e Membro da Ordem Nacional do Mérito Científico na classe de Comendador. Na área de editoria científica, é revisor de revistas científicas internacionais, membro do corpo editorial da revista Tropical Plant Biology publicada pela Springer, New York e editor associado da revista The Plant Genome, uma publicação da Crop Science Society of America. Como atividades de política científica, atuou como membro e coordenador do GT do PADCT, membro e coordenador do Comitê Assessor de Genética do CNPq, membro da coordenação do programa Genoma da FAPESP, membro do Comitê Assessor do Fundo Setorial de Biotecnologia do MCT e membro de comitês assessores de vários organismos internacionais como FAO, PNUD e UNU. No âmbito do desenvolvimento tecnológico, foi sócio fundador da empresa Alellyx Applied Genomics, a primeira empresa brasileira de genômica vegetal aplicada.

Dr. Márcio José Silva

Pesquisador

Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual de Campinas (1979), graduação em Ciências Biomédicas pela Universidade Estadual de Campinas (1982), mestrado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Campinas (1991) e doutorado em Genética e Biologia Molecular pela Universidade Estadual de Campinas (1997). Atualmente é Pesquisador A do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética - CBMEG da Universidade Estadual de Campinas. Tem experiência na área de Genética, com ênfase em Biologia Molecular de Plantas, atuando principalmente nos seguintes temas: expressão gênica, transformação de plantas, proteínas/óleos de reserva em sementes e biocombustíveis/biodiesel.

LINHAS DE PESQUISA

🧑‍🔬 Genética Vegetal voltada para o metabolismo energético

O principal foco é entender como as angiospermas gerenciam recursos energéticos para otimizar seu crescimento e desenvolvimento em uma perspectiva adaptativa.

 

PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO VINCULADO

EQUIPE

Prof. Dr. Paulo Arruda

Pesquisador e Coordenador

parruda@unicamp.br
(19) 3521.1148

Dr. Márcio José Silva

Pesquisador

marciojs@unicamp.br
(19) 3521.1148

Sandra de Almeida Queiróz

Bióloga

drago2@unicamp.br
(19) 3521.1139

SERVIÇOS

  • Distribuição, depósito e caracterização de isolados microbianos
  • Análise de polimorfismos de DNA por SSR (microssatélites) e SNPs
  • Genotipagem para estimar número de cópias e expressão gênica
  • Transformação genética de milho
  • Realização de experimentos para avaliação fenotípica em plantas em casa de vegetação e câmara de crescimento

PUBLICAÇÕES SELECIONADAS

  • AJG Simpson, FC Reinach, P Arruda et al (2000) The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa. Nature 406, 151
  • AL Vettore, FR da Silva, EL Kemper, ...P Arruda (2003) Analysis and functional annotation of an expressed sequence tag collection for tropical crop sugarcane. Genome research 13, 2725-2735. https://doi.org/10.1038/35018003.
  • IAP Neshich, E Kiyota, P Arruda (2013) Genome-wide analysis of lysine catabolism in bacteria reveals new connections with osmotic stress resistance. The ISME journal 7, 2400. https://doi.org/10.1038/ismej.2013.123.
  • P Barreto, V Okura, IA Pena, R Maia, IG Maia, P Arruda (2015) Overexpression of mitochondrial uncoupling protein 1 (UCP1) induces a hypoxic response in Nicotiana tabacum leaves. Journal of Experimental Botany 67, 301-313. https://doi.org/10.1186/1471-2229-14-144
  • E Kiyota, IA Pena, P Arruda (2015) The saccharopine pathway in seed development and stress response of maize. Plant, Cell & Environment 38, 2450-2461.
  • RSC De Souza, VK Okura, JSL Armanhi, B Jorrín, N Lozano, MJ Da Silva, M González-Guerrero, LM Araújo, NC Verza, HC Bagheri, J Imperial, P Arruda (2016) Unlocking the bacterial and fungal communities’ assemblages of sugarcane microbiome. Scientific Reports 6, 28774. https://doi.org/10.1038/srep28774.
  • JSL Armanhi, RSC De Souza, LM De Araújo, VK Okura, P Mieczkowski, J Imperial, P Arruda (2016) Multiplex amplicon sequencing for microbe identification in community-based culture collections. Scientific Reports 6, 29543. https://doi.org/10.1038/srep29543.
  • JSL Armanhi, RSC de Souza, NB Damasceno, LM de Araújo, J Imperial, P Arruda (2018) A community-based culture collection for targeting novel plant growth-promoting bacteria from the sugarcane microbiome. Frontiers in Plant Science 8, 2191. https://doi.org/10.3389/fpls.2017.02191.
  • Barreto, Pedro, Charlene Dambire, Gunjan Sharma, Jorge Vicente, Rory Osborne, Juliana Yassitepe, Daniel J. Gibbs, Ivan G. Maia, Michael J. Holdsworth, and Paulo Arruda. 2022. Mitochondrial Retrograde Signaling through UCP1-Mediated Inhibition of the Plant Oxygen-Sensing Pathway. Current Biology 32 (6): 1403-1411.e4. https://doi.org/10.1016/j.cub.2022.01.037.

CONTATO

Coordenadores responsáveis:

Dr. Paulo Arruda

Email: parruda@unicamp.br

Dr. Marcio José da Silva

Email: marciojs@unicamp.br

Endereço:
Av. Cândido Rondon, 400 - Cidade Universitária, Campinas - SP, 13083-875

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